Nadat de Amerikaanse geleerde Eric S. Lander in 1996 formeel single nucleotide polymorphism (SNP) had voorgesteld als de derde generatie moleculaire marker, is SNP op grote schaal gebruikt bij analyse van economische eigenschappen, de constructie van biologische genetische koppelingskaarten en screening van menselijke pathogene genen., diagnose en voorspelling van ziekterisico's, geïndividualiseerde screening van geneesmiddelen en andere biologische en medische onderzoeksgebieden.Op het gebied van veredeling van marktgewassen kan detectie van SNP een vroege selectie van vereiste eigenschappen realiseren.Deze selectie heeft de kenmerken van hoge nauwkeurigheid en kan de interferentie van morfologie en omgevingsfactoren effectief voorkomen, waardoor het kweekproces aanzienlijk wordt verkort.Daarom speelt SNP een grote rol op het gebied van fundamenteel onderzoek.

Single Nucleotide Polymorphism (Single Nucleotide Polymorphism, SNP) verwijst naar het fenomeen dat er enkele nucleotide verschillen zijn op dezelfde positie in de DNA-sequentie van individuen van dezelfde of verschillende soorten.Het invoegen, verwijderen, omzetten en omkeren van een enkele basis kan allemaal dit verschil veroorzaken.In het verleden was de definitie van SNP anders dan die van mutatie.Een variante locus vereist dat de frequentie van een van de allelen in de populatie groter is dan 1% om te worden gedefinieerd als een SNP-locus.Met de uitbreiding van moderne biologische theorieën en de toepassing van technologie is de allelfrequentie echter niet langer een noodzakelijke voorwaarde om de definitie van SNP te beperken.Volgens de single nucleotide variatiegegevens die zijn opgenomen in de Single Nucleotide Polymorphisms (dbSNP) -database onder het National Center for Biotechnology Information (NCBI), zijn laagfrequente insertie / deletie, microsatellietvariatie, enz. Ook inbegrepen.

In het menselijk lichaam is de frequentie van SNP 0,1%.Met andere woorden, er is gemiddeld één SNP-site per 1000 basenparen.Hoewel de frequentie van voorkomen relatief hoog is, kunnen niet alle SNP-sites kandidaat-markers zijn die verband houden met kenmerken.Dit heeft vooral te maken met de locatie waar de SNP plaatsvindt.

Theoretisch kan SNP overal in de genoomsequentie voorkomen.SNP's die voorkomen in het coderende gebied kunnen synonieme mutaties en niet-synonieme mutaties produceren, dat wil zeggen, het aminozuur verandert of verandert niet voor en na de mutatie.Het veranderde aminozuur zorgt er meestal voor dat de peptideketen zijn oorspronkelijke functie verliest (missense-mutatie) en kan ook leiden tot het afbreken van de vertaling (nonsense-mutatie).SNP's die voorkomen in niet-coderende regio's en intergene regio's kunnen de mRNA-splitsing, niet-coderende RNA-sequentiesamenstelling en de bindingsefficiëntie van transcriptiefactoren en DNA beïnvloeden.De specifieke relatie wordt weergegeven in de figuur:

SNP-typen:

Verschillende veelgebruikte SNP-typemethoden en hun vergelijking

Volgens verschillende principes zijn veelgebruikte SNP-detectiemethoden onderverdeeld in de volgende categorieën:

Classificatievergelijking van detectiemethoden

Opmerking: In de tabel staan ​​momenteel de meest gebruikte SNP-detectiemethoden, andere detectiemethoden zoals specific site hybridization (ASH), specific site primer extension (ASPE), single base extension (SBCE), specific site cutting (ASC), genchiptechnologie, massaspectrometrietechnologie, etc. zijn niet geclassificeerd en vergeleken.

De kosten en tijd van nucleïnezuurzuivering in de verschillende hierboven genoemde veelgebruikte SNP-detectiewerkwijzen zijn onvermijdelijk.Gerelateerde kits op basis van de directe PCR-technologie van Foregene kunnen echter rechtstreeks PCR- of qPCR-amplificatie uitvoeren op ongezuiverde monsters, wat een ongekend gemak biedt voor SNP-detectie.

Foregene's producten uit de directe PCR-serie laten eenvoudig en ruwweg de monsterzuiveringsstappen achterwege, wat de tijd en kosten die nodig zijn om sjablonen voor te bereiden aanzienlijk vermindert.De unieke Taq-polymerase heeft een uitstekend amplificatievermogen en kan verschillende remmers uit complexe amplificatieomgevingen verdragen.Deze kenmerken bieden een technische garantie voor het verkrijgen van specifieke producten met een hoge opbrengst. Foregene Direct PCR/qPCR-kits voor verschillende soorten monsters, zoals: dierlijke weefsels (rattenstaart, zebravis, enz.), bladeren van planten, zaden (inclusief monsters van polysacchariden en polyfenolen), enz.